Mitochondrien sind potentielle End-Effektoren der endogenen Kardioprotektion. Eine erhaltene Mitochondrienfunktion nach Myokardinfarkt ist entscheidend für das Überleben der Kardiomyozyten und damit für die Reduktion der finalen Infarktgröße. Typische Untersuchungen an aus Herzmuskelgewebe isolieren Mitochondrien umfassen die mitochondriale Respiration, die Calcium-Retentionskapazität, die Adenosintriphosphat-Produktion und die Produktion freier Sauerstoffradikale.

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