Transkription und Transkriptionsregulation: Das archaeale Modellsystem

Das Vorhandensein von nur drei Homologen der eukaryalen generellen Transkriptionsfaktoren (GTFs) in Archaea und die Ähnlichkeit der Promotor-Struktur/Organisation führt dazu, dass die archaeale Transkription generell als ein vereinfachtes Modell der eukaryalen Transkription angesehen wird.

In diesem Projekt zur basalen Transkription versuchen wir, die Bedeutung von multiplen Transkriptionsfaktoren (TFB1-4) inThermoproteus tenax zu entschlüsseln und Transkriptionsregulatoren zu identifizieren. Dieses Projekt wird im Rahmen desGraduiertenkollegs ("Transcription, Chromatin Structure and DNA Repair in Development and Differentiation") an der Universität Duisburg-Essen durchgeführt.

Fokussierter ZKM DNA-Microarray (Zentraler Kohlenhydrat-Metabolismus) Thermoproteus tenax [28].

Eine fokussierte Transkriptom-Analyse zum ZKM wurde für T. tenax (DNA-Microarray) durchgeführt und lieferte erste vielversprechende Ergebnisse für die Veränderung der Expression der ZKM Gene in Abhängigkeit von autotrophen bzw. heterotrophen Wachstumsbedingungen [28]. Transkriptom-Studien für das gesamte T. tenax Genom sind derzeit in Planung. Zukünftige Ziele dieses Projektes sind die Identifizierung von Regulons und DNA-Bindestellen über die Kombination von DNA-Microarray mit Chromatin Immunopräzipitation und „run-off in vitro transcription".