In der Tierhaltung der Aquatischen Ökologie halten wir verschiede Fischarten, zumeist Aale (Anguilla anguilla) und Döbel (Squalius cephalus). Unser Tierbestand variiert stark und liegt maximal im Bereich von 100 Fischen. Diese Fische werden vor allem für die Aufrechterhaltung von Lebenszyklen verschiedener Parasiten wie dem Schwimmblasennematoden Anguillicola crassus oder Kratzwürmern (Acanthocephalen) genutzt. Sie werden aber auch für Untersuchungen zur Wirkung unterschiedlicher Stressoren auf Fische verwendet. Die Fische werden in Gruppen von 20-30 Tieren in Becken mit 500 Litern Wasser gehalten. Für Versuche stehen zudem verschieden große Aquarien zur Verfügung, in denen die Fische in einem Durchflusssystem gehalten werden. Aus hygienischen Gründen werden die Fische ohne natürlichen Bodengrund gehalten, jedoch stehen Versteckmöglichkeit (z.B. Kunststoffröhren, abgedunkelte Bereiche) zur Verfügung, die von den Fischen eigenständig aufgesucht werden können. In den Becken werden regelmäßig Futterreste und Kot abgesaugt und Wasserwechsel durchgeführt, um eine konstante Wasserqualität aufrecht zu erhalten.

In unserer Aquarienanlage können Fische in 50-200 L-Aquarien in stehendem Wasser oder im kontinuierlichen Wasserdurchlauf gehalten werden. Damit bieten sie optimale Haltungsbedingungen für verschiedene Süßwasser-Fischarten wie Aale, Döbel oder Stichlinge. Je nach Größe können die Fische hier einzeln oder in kleinen Gruppen gehalten werden.

In den 500 L fassenden Fischtanks können größere Zahlen von Fischen gehalten werden. Die aufliegenden Netze verhindern das Herausspringen der Fische. Der Auslass an der Unterseite der Tonnen vereinfacht den regelmäßigen Wasserwechsel.